Het gebouw werd opgericht als een klooster voor de broers van de derde orde van Saint Franciscus die hier vanaf de eerste helft van de 16e eeuw woonde.De architectuur van de kerk is voornamelijk origineel, gebouwd door de Franciscanen en ontworpen door Martino Bassi in 1590. Hij was ook de auteur van twee reliëfsculpturen die boven de zijdeuren werden geplaatst.
Het interieur is een enkel schip van ionische orde met acht intercommunicerende laterale kapellen.Een fresco die de veronderstelling weergeeft, is te zien op de vatkluizen van het schip.Het werd oorspronkelijk toegeschreven aan Andrea Pellegrini en vervolgens opnieuw geverfd door Ferdinando Porta in 1737. In 1896 werd de gevel opnieuw ontworpen door Ernesto Pirovano.Het gebouw onderging verschillende herstructureringsprocessen tussen de 19e en 20e eeuw, zoals het herstel van de pastorie.Een altaar in wit en roze marmeren werd opgericht en er werd een houten stoel ervoor geplaatst.De allereerste steen van het kloostercomplex en de kerk van S. Maria al Paradiso werd op 27 juni 1590 gelegd tijdens het bisschoppelijk van Gaspare Visconti, opvolger van San Carlo Borromeo.Een ronde steen met een centraal gat is te vinden in de vloer halverwege de kerk.Traditie is dat het een basis was voor het kruis van St. Barnaba en een belangrijk teken van de oorsprong van het christendom in Milaan.
De steen werd gevonden in de basiliek van San Dionigi, buiten de Porta Orientale (nu Porta Venezia), en hier getransporteerd door de Servite Fathers.
Er zijn acht schilderijen in de verschillende kapellen van de kerk: "San Carlo" die de eucharistie beheert aan de melaatse, toegeschreven aan Andrea Porta, "Sant'anna" door Giulio Cesare Procaccini en, in de linker kapel, "SantaLucia ”door Francesco Fabbrica.Er is ook een schilderij van Chignoli die de "Miracolo Degli Angeli Che Arano Al Posto del Santo" (Miracle of the Angels die ploegen in plaats van de heilige) weergeven. Boven de drie toegangsdeuren zijn "Nascita di Maria" (geboorte van Mary) en"La Presentazione Al Tempio" (de presentatie van Christus in de tempel) toegeschreven aan Giuseppe Leva.