Scuola Normale Superiore grundades 1810 av Napoleonedekret, som Twin Institution för école Normale Supérieure i Paris, själv från den franska revolutionens jurisdiktion.Termen "École Normale" ("Scuola Normale") myntades av Joseph Lakanal som, när han lämnade in en rapport till den nationella kongressen från 1794 på uppdrag av kommittén för offentlig instruktion, förklarade det på följande sätt: "Normales: Du Latin Norma,règle.Ces écoles doivent être en effet le typ et la règle de toutes les autres ”.

Napoleon Jag tänkte om projektet av en école Normale 1808, genom att etablera en ”Normale” -hall i Paris, för att hysa unga studenter och utbilda dem i konsten att undervisa humaniora och vetenskaper.Projektet replikerades i Toscana genom ett dekret daterat 18 oktober 1810, med stiftelsen i Pisa, säte för en av de imperialistiska universitetets akademier, av en filial av école Normale Supérieure i Paris, kallad Scuola Normale Superiore.

När 1814, Ferdinand III, återvände grand hertig av Toscana till Toscana, projektet för en Scuola Normale i Pisa upphörde.Först i början av 1840-talet, i samband med universitetsreformen 1839-1841, återupptogs projektet.Frågan kombinerades med förslagen om återupptagande av utbildningsverksamheten i den forntida ordningen Saint Stephen, vars huvudsakliga lokaler var inom Palazzo della Carovana i Pisa.Den 28 november 1846 grundade en grand-hertig motu proprio en toskansk scuola normale i pisa (även kallad den kejserliga kungliga scuola normalen, eftersom den var kopplad till det österrikiska systemet), med både teoretiska och praktiska mål, under patronage avSaint Stephens ordning, men beroende på University of Pisa.
Den 17 oktober 1862 genomförde utbildningsministern i Italien Carlo Matteucci nya förordningar i ett dekret som förvandlade institutionen till den berömda "Normal School of the Kingdom of Italy".Det skulle finnas en organisk uppdelning i två fakulteter, av konst och vetenskap.

1863 utnämndes till en ny chef för Scuola Normale, den respekterade Pasquale Villari.Villari lämnade Scuola 1865, och hans plats togs av matematikern Enrico Betti;Från 1890 till 1900 fylldes regissörens ställning av litteraturhistorikern Alessandro d'Ancona och från 1900 till 1918 av matematikern Ulisse Dini.De nya förordningarna, som utfärdades av minister Michele Coppino 1877, granskade och förenklade de interna studiföreskrifterna och utjämnade, ur organisatorisk synvinkel.

Filosofen Giovanni Gentile placerades i spetsen för Scuola Normale som kommissionär 1928 och som direktör 1932. Han spenderade lokalerna för Scuola Normale, Palazzo Dei Cavalieri, och offentliggjorde också en ny stadga i1932, som erkände Scuola Normale som ett avancerat utbildningsinstitut med ”en juridisk status och administrativ, utbildnings- och disciplinär autonomi” och försäkrade en autonomi från University of PISA.Vidare reformerade han Scuola, gav den formell autonomi och sökte en utvidgning till andra discipliner, med skapandet av Collegio Mussolini per Le Scienze Corporativ (1931) och Collegio Nazionale Medico (1932).De nya högskolorna slogs senare samman i Collegio Medico-Giuridico, som fortsatte att fungera (inom områdena lag och medicin) under jurisdiktion av Scuola Normale Superiore di Pisa.

Under efterkrigstiden fanns det många praktiska svårigheter;Men förutom restaureringen av Palazzo dei Cavalieri.Scuola Normale 1951 inrättade Antonio Pacinotti internatskola, reserverade för studenter vid fakulteterna för jordbruk, ekonomi och teknik, med planer på att ytterligare öppnas för andra fakulteter.1967 slog SCUOLA Superiore di Studi Universitari E Perfezionamento, Scuola per Le Scienze Applicate A. Pacinotti (grundades 1951) och Collegio Medico-Giuridico som bildade Sant'anna School of Advanced Studies.Den nya institutionen, även om den fortfarande var engagerad i den modell som fastställts av Scuola Normale Superiore di Pisa, administrerades av University of Pisa.1987 förvärvade Sant'anna School of Advanced Studies fullständig oberoende (lag den 14 februari 1987, nr 41) och upprätthåller starka band med både Scuola Normale Superiore Di Pisa och University of Pisa som skapar PISA University System.

Med tiden har Scuola Normale i allt högre grad öppnat för samhället, och även om det förblir ett elitinstitut, har erbjudit sin kulturella verksamhet och arv till en allt bredare publik