La Basílica de Sant'Agata Maggiore se encuentra en el centro de la ciudad, a solo unos pasos de la Basílica de San Francisco. Es una de las iglesias más antiguas de la ciudad, ya que fue erigida en el siglo quinto durante el episcopado de Pedro II (494-519 dC) cuyo monograma aún es visible en la nave. El ábside fue construido en el siglo siguiente durante el obispado de Agnello (556-569 dC) con la contribución de Julianius Argentarius.
El piso de la iglesia original está ahora a aproximadamente 2.50 metros por debajo del nivel del suelo.

Con el tiempo, la iglesia ha sufrido varios cambios. En el patio que lo rodea (antes cementerio) había un porche de cuatro lados, reemplazado en el siglo XVI por un campanario circular. En 1688, los mosaicos del ábside fueron destruidos por un terremoto y el piso se elevó 2,50 metros.

Durante los trabajos de restauración realizados entre 1913 y 1918 por Giuseppe Gerola, se agregaron a la fachada un protiro y una ventana de mármol con parteluz. El interior está dividido en una nave y dos naves. La estructura se apoya en columnas, algunas de las cuales están coronadas por capiteles corintios del siglo VI.
Un antiguo santuario cerca del altar de Santa Ágata conserva las cenizas de San Sergio Mártir y el Obispo Agnellus. Arriba, una pintura de Luca Longhi de 1546 muestra a Santa Ágata entre los santos Catalina de Alejandría y Cecilia.