El primer núcleo de construcción residencial que estaba destinado a convertirse en el palazzo Isimbardi se inició durante la era Sforza.
Desde el siglo XVI en adelante, el edificio cambió de manos muchas veces; Fue adquirido por familias nobles que, durante su tiempo, modificaron las características internas y externas para llevarlo al edificio actual que admiramos hoy.
En 1775, los marqueses Isimbardi compraron el edificio y lo mantuvieron en la familia hasta 1908; El palazzo todavía lleva el nombre de la familia. En los años 30, las Autoridades Provinciales de Milán adquirieron la propiedad como su sede y decidieron restaurar y conservar los elementos arquitectónicos creados a lo largo de las diferentes épocas.
El nuevo palacio fue inaugurado el 24 de octubre de 1942; alrededor de media hora después, los primeros bombardeos estallaron en Milán rompiendo el cristal en todas las ventanas. La tarea de reconstrucción y renovación duró desde 1950 hasta 1953 y fue confiada a Reggiori, el arquitecto que estuvo a cargo de los trabajos de construcción anteriores.
El nombre decimonónico "Palazzo Isimbardi" se añadió definitivamente en los años 50.
Hoy en día, el palacio es la sede de las Autoridades Provinciales de Milán y los organismos institucionales de esta organización.
La Sala della Giunta (sala del comité del consejo), que se puede visitar a pedido, presenta una pintura de Tiepolo que representa "El triunfo del dux Francesco Morosini".
La extensión moderna en la esquina de via Vivaio fue diseñada de Giovanni Muzio en 1940. Las esculturas de la fachada son de Ivo Sioli.
El 9 de mayo de 2008, una estatua "L'uomo della Luce" (Hombre de luz) se colocó en la plaza justo enfrente del palacio, un regalo para los ciudadanos de Milán de parte de las Autoridades Provinciales; Con motivo del Día de la Memoria para todas las víctimas del terrorismo y asesinato para conmemorar el aniversario del asesinato de Aldo Moro.