Da Fundação do Século XVIII, como as Coleções Universitárias de Paleontologia e Mineralogia, com a qual compartilha a origem, o Museu de Zoologia e a Anatomia Comparativa tem como objetivo que a preservação da fauna achados de particular interesse para o território local.

Seguindo legados de cidadãos e compras de Modena, que ocorreram em várias ocasiões entre 1830 e 1845, a herança do museu aumentou rapidamente, especialmente no setor ornitológico, também graças a doações frequentes de Duke Francesco IV de ambos os exóticos Espécimes levantados ao tribunal e mortes em cativeiro e fauna local.

Recentemente, as coleções zoológicas viram um novo aumento graças ao material doado por indivíduos ou órgãos públicos ou provenientes de seqüestros realizados em taxidermistas ou confiscados de caçadores ou resultado de coleções de estudos.Instalado no contexto do Departamento de Biologia Animal da Universidade, agora conta aproximadamente 3000-3500 vertebrados naturalizados (pássaros, mamíferos, peixes, répteis), uma centena das quais pertencentes à "fauna de vertebrados do modenese", montada no forma de pequenos dioramas;Cerca de 1000 espécimes de vertebrados (especialmente peixes e répteis) preservados sob líquidos;Cerca de 250 esqueletos e partes anatômicas dos vertebrados;Algumas centenas de invertebrados preservados em álcool ou formalina.

A herança também inclui uma importante coleção malacológica que consiste em alguns milhares de caixas, cada uma das quais com uma ou mais amostras;Cem caixas entomológicas com um número desconhecido de espécimes;Uma dúzia de exibições contendo uma rica coleção de animais parasitários e venenosos (coleção Franchini).