L'église conserve encore sa structure de style dominicain du XIIIe siècle. Les dominicains sont venus à Piacenza vers 1220 et, après avoir reçu des dons près du ruisseau Beverora, ils ont fondé une église avec un monastère annexé dédié à Saint Jean «in canale» afin de la distinguer des autres églises dédiées au même saint.

Près de l'église San Giovanni se trouvait l'église de Santa Maria del Tempio, qui abritait les Templiers. Lorsque l'ordre fut supprimé en 1312, le bâtiment fut oublié jusqu'à sa disparition totale dans la seconde moitié du dernier siècle. Les Dominicains de Piacenza ont défendu l'Inquisition (la salle d'audience est encore visible), qui a été supprimée à Piacenza en 1797 sous la domination française.

À l'intérieur de San Giovanni in Canale, il y a un monument sépulcral intéressant, dont l'un du XIVe siècle appartient à la famille Scotti. Aux XVIe et XVIIe siècles, l'église a été rénovée à l'intérieur selon le goût de l'époque, avec des décorations en stuc et dorées. À partir du 19ème siècle se trouve la chapelle majestueuse de Rosario, de style néoclassique et décorée de toiles de Gaspare Landi et Vincenzo Camuccini.