La Universidad de Pavia Museo di Storia Naturale fue creada en 1771 por orden de María Teresa de Austria, quien nombró a Lazzaro Spallanzani, titular de la cátedra de historia natural, como su director. Las colecciones se expandieron considerablemente bajo su guía a través de compras, intercambios y donaciones, y el museo pronto se convirtió en uno de los más famosos de su tipo en Europa.
El siglo XIX vio un segundo período de esplendor con una mayor expansión de las colecciones, entre otras cosas gracias a las contribuciones de los grandes exploradores.
El museo actualmente alberga el material antiguo en diferentes locales. La sección de zoología incluye miles de aves y mamíferos disecados, numerosos anfibios, reptiles y peces conservados en líquido, y una colección muy rica de insectos.
La sección Anatomía comparativa incluye preparaciones de órganos y esqueletos montados, y la importante sección de paleontología cuenta con más de 30,000 especímenes de animales y plantas fósiles.
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