Die Kirche wurde zwischen 1236 und 1254 von der Franziskanergemeinschaft errichtet. Die Mitglieder der Gemeinde kamen 1218 in Bologna an, als Bernardo di Quintavalle, einer der ersten Schüler von San Francesco, hierher zog. San Francesco kam einige Jahre später zu seinen Schülern nach Bologna.

Gegenwärtig ist die Kirche eine Art Pastiche verschiedener Stile, darunter Romanik, Gotik und Frührenaissance.

Die hohe gotisch-romanische Fassade, die zwei Glockentürme (die größte aus den frühen Jahren des 15. Jahrhunderts und die andere aus dem Jahr 1260) sowie die Bögen in den Kapellen sind besonders wichtig. Neben den Kapellen befinden sich zwei Gebäude aus dem 12. Jahrhundert, in denen Accursio, Odofredo und Rolandino de 'Romanzi begraben wurden.

Im Inneren der Kirche, umgeben von einer strengen und imposanten Struktur, sticht ein wunderschönes Altargemälde aus Marmor hervor: Es wurde zwischen 1388 und 1393 von den Venezianern Jacobello und Pier Paolo dalle Masegne gestaltet. Darüber hinaus gibt es einige bemerkenswerte Grabdenkmäler wie das von Sperandio (1482) entworfene Grab von Papst Alexander V., die romanische Muzzarelli-Kapelle und die luftigen Kreuzgänge (14. und 15. Jahrhundert) des nahe gelegenen Klosters.