Pinacoteca se nachází nedaleko Le Due Torri (dvě věže, symboly Bologny), uvnitř bývalého noviziato gesuita di sant'ignazio, místo postavené ve druhé polovině 15. století, aby přivítaly mladé lidi, kteří to chtěli vzítčást Ježíšovy společnosti.
Kromě Pinacoteca hostí budova také Accademia Delle Belle Arti a Sopraintendenza podle IL Patrimonio Storico Artistica ed etnoantropologico, včetně výstav a ochrany, ochrany nebo výzkumných činností souvisejících s historickým a kulturním dědictvím.
V roce 1762 daroval monsignor Francesco Zambeccari některé ze svých obrazů ze 16. století Accademia Clementině, pocházející z prestižní Accademia Dei Desiderosi, vytvořené rodinou Carracci v roce 1582, čímž se zrodilo sběr.
Od roku 1803 je Accademia Clementina nahrazena Accademia di Belle Arti, čímž se stává Quadreria a získává své umělecké dědictví, později obohacené dalšími dary.
Po potlačení instituce napoleonskými jednotkami byla nejdůležitější umělecká díla poslána do Paříže a Milána (v Musée Napoleon a budoucí Accademia di Brera), kde byly drženy až do páduFrancouzská říše, když byli TRASportováni zpět na své rané místo, Quadreria, která se později stala známou jako Pinacoteca.
Tímto způsobem byla vytvořena současná základna sbírky, první katalog s 274 obrazy pochází z roku 1827.Laici a aristokratičtí lidé, čímž dokončili svůj umělecký itinerář mezi 14. a 19. století, a tak se stali jednou z nejdůležitějších uměleckých sbírek v Evropě.
Pinacoteca di Bologna je nyní považována za jednu z nejmodernějších a nejdůležitějších národních galerií, původně otevřena v roce 1885 poté, co byla rozdělena akademií.
Expozice je založena na různých sekcích rozdělených podle různých škol: a itinerář shromažďuje umělecká díla sahající až do 14. a 15. století (Vitale da Bologna atd.), Až do renesančního období (Raffaello, Perugino,Tintoretto atd.), Manýrismus (Giorgio Vasari, Bartolomeo Cesi atd.), Včetně malby velkých velikostí 16. století.
Pinacoteca byla zcela zrekonstruována v roce 1997 a v současné době hostitelé, kromě 30 výstavních místností, prodej Della Belle Arti a velmi moderní pokoje v suterénu, díky které je budova schopna hostit střední a velké dočasné výstavy, didaktické, didaktickéaktivity, semináře a konference.