Museets lokaler är i den forntida Spedale Nuovo, byggda i mitten av 1200 -talet, av påven av påven Alexander IV för att vara en "pellegrinaio" (tillflykt för pilgrimer) för att registrera försoningen mellan Pisa och Holy See.Vi är skyldiga spedalen till Giovanni di Simone, av vissa anses vara arkitekten på den monumentala kyrkogården.

Byggnaden förblev en del av sjukhuset fram till 1969, då det beslutades att renovera den och använda den som lokaler för Museo delle Sinopie.Den 27 juli 1944 satte ett granatskott av amerikansk artilleri eld på taket på Camposanto.Smält bly hällde över freskorna på väggarna.Vid den tidpunkten trodde man att det enda botemedlet att rädda dessa målningar var att ta bort dem från väggarna.Denna operation avslöjade Sinopias, det vill säga de förberedande ritningarna i röd ockra under freskorna.På grund av deras sårbarhet avlägsnades också dessa från väggarna och placerades i det nya museet, designade, förberedda och arrangerade av Giovanna Piancastelli Politi, Gaetano Nencini E Antonino Caleca.

Detta är den största samlingen av medeltida ritningar i världen.I den uppfattar vi konstnären som arbetar i full spate av hans kreativitet.På många ställen kan flera händer särskiljas, även där det slutliga resultatet är enhetligt i stil, till exempel i korsfästelsen som tillskrivs Francesco Traini (1335) och triumfen för döden, sista dom och thebaidcykeln, troligen arbetet med buffalmakco.De förberedande ritningarna (Sinopias) från senare cykler (slutet av 1300 till 1400 -talet) såsom berättelserna om Job, av Taddeo Gaddi, berättelserna om St. Ranier av Andrea Bonaiuti och berättelser från Gamla testamentet av Benozzo Gozzoli visas också i The Display in the Display in the themuseum.