Prostory muzea jsou ve starověkém Spedale Nuovo, postavené v polovině 13. století, vůli papeže Alexandra IV, jako „Pellegrinaio“ (útočiště pro poutníky) zaznamenat usmíření mezi Pisou a Svatým stolkou.Dlužíme Spedale Giovanni di Simone, někteří považováni za architekt monumentálního hřbitova.

Budova zůstala součástí nemocnice až do roku 1969, kdy bylo rozhodnuto ji rekonstruovat a použít jako prostory pro Museo Delle Sinopie.Dne 27. července 1944 granát střílel americkým dělostřeleckým zapálením na střechu Camposanta.Roztavený olovo nalil na fresky na stěnách.V té době se předpokládalo, že jediným lékem, který tyto obrazy zachránil, bylo odstranit je ze zdí.Tato operace odhalila sinopie, tj. Přípravné výkresy v červeném okru pod Fresky.Kvůli jejich zranitelnosti byly také svléknuty ze zdí a vloženy do nového muzea, navrženého, ​​připraveného a uspořádaného Giovanna Piancastelli Politi, Gaetano Nencini e Antonino Caleca.

Toto je největší sbírka středověkých kreseb na světě.V tom vnímáme umělce pracujícího v plném množství jeho kreativity.Na mnoha místech lze rozlišit několik rukou, i když je konečný výsledek ve stylu jednotný, například v ukřižování připisovanému Francesco Traini (1335) a triumfu smrti, poslední úsudek a TheBaid Cycle, pravděpodobně práce Buffalmacco.Přípravné kresby (sinopie) pozdějších cyklů (koncem 1300 až 1400), jako jsou příběhy o Job, Taddeo Gaddi, jsou také vystaveny příběhy St. Raniera od Andrea Bonaiuti a příběhy ze Starého zákona Benozzo Gozzolimuzeum.