O primeiro cemitério judaico em Bolonha, localizado entre a Igreja de Baraccano e a Igreja de San Pietro Martire, foi fechada em 1569 após a expulsão dos judeus da cidade.Para não deixar vestígios, seu cemitério foi cedido às freiras de San Pietro e depois destruído completamente.As quatro lápides do Museu Medieval vêm deste local antigo.

Particularmente digno de nota é a lápide de Shabatài Elkanàn de Rieti, que é um exemplo raro de arte figurativa judaica, uma vez que a regra que proíbe a criação de imagens granadas não foi observada.A frente, em uma base rústica, apresenta um busto de um jovem segurando um pergaminho com uma epígrafe em personagens judeus.A parte de trás apresenta uma cabeça alada com base em bases, segurando um texto poético em hebraico e dois putti alados esculpidos decoram as laterais.Essas pedras são testemunhos importantes não apenas da arte funerária, mas também do estilo de escrita judaica da época.
O atual cemitério judaico, estabelecido em 1869, está localizado no cemitério Monumental Certosa de Bolonha.