Durante séculos, a Basílica serviu como Igreja Batismal.Em 1340, Giovanni da Campione construiu um batistério dentro, que permaneceu lá até 1660, quando o rito batismal foi transferido para a Catedral.Em 1898, o batistério foi reconstruído em estilo neogótico por Viginio Muzio.As estátuas que descrevem as virtudes fora da igreja são originais, juntamente com a estátua de São João Batista e os relatórios de bases da vida de Jesus encontrados no interior.