De catacomben van San Callisto zijn de bekendste van de Romeinse catacomben en de eerste officiële ondergrondse begraafplaats voor vroege christenen, waaronder vele martelaren van de tweede en derde eeuw.Het was waarschijnlijk Calixtus die voornamelijk verantwoordelijk was voor de kerk die de wettelijke eigenaar van de begraafplaatsen werd.Calixtus werd benoemd tot beheerder van de begraafplaats die zijn naam draagt ​​door paus Zephyrinus.In 217 volgde hij Zephyrinus op als paus en vijf jaar later stierf hij.

Opgravingen hebben vijf verschillende niveaus van loculi onthuld, niches waar de lichamen, gewikkeld in vellen, in lagen werden geplaatst.De openingen voor de loculi waren gesloten met platen van marmer, maar deze zijn al lang verdwenen, evenals eventuele waarde -artefacten.Een belangrijke attractie is de pauselijke crypte met de overblijfselen van verschillende gemartelde vroege pausen.In de buurt, met zijn Byzantijnse fresco's, is het kubiculum van St. Cecilia, wiens lichaam hier werd ontdekt door paus Paschal I en in Santa Cecilia in het slijtage verhuisde.Andere cabines hebben fresco's en christelijke symbolen gesneden op de muren.In de crypte van St. Eusebius is een sarcofaag met twee gemummificeerde lichamen.