La abadía de San Zenón fue construida en el siglo IX sobre los restos de un monasterio preexistente, cuyos orígenes se remontan al siglo IV. Hoy solo sobrevivieron la torre de la abadía y algunos de los claustros que ahora forman parte de la basílica de San Zeno. La abadía ha sido muy importante para la historia de Verona y para las relaciones entre los emperadores alemanes e Italia. Fue destruido principalmente durante la era napoleónica y, por lo tanto, no siguió el destino de las otras propiedades de la abadía en Verona, que fueron capturadas por los franceses antes de convertirse en propiedad de los austriacos, a veces canjeadas como en el caso de Santa María en Organo. Desde principios del siglo XIX comenzó un período de eliminación de la antigua abadía y el convento benedictino, que terminó a mediados del siglo XX. Desde la segunda guerra mundial, se ejecutaron varias restauraciones, en particular la torre y parte de la abadía original, ahora completamente restauradas y abiertas para la visita.