La tradición cuenta que una primera iglesia dedicada a Santa Sofía fue erigida durante la era de Carlomagno y los lombardos, en el sitio de un templo pagano anterior. El borgo circundante también tomó el nombre de Santa Sofía. La iglesia actual fue construida entre 1106 y 1127, gracias al premio de los diezmos del borgo, por el Obispo Sinibaldo. El techo abovedado y el campanario románico-gótico datan del siglo XIV. La iglesia no muestra ningún esquema de decoración general, pero hay frescos individuales que datan de los siglos XIII-XIV. Una de ellas representa a una Madonna con el Niño, del tipo Eleousa, que muestra el sentimiento de afecto amoroso. La pintura muestra un estilo similar al de la persona desconocida que iluminó la copia personal de las Epístolas de Giovanni da Galibana, en 1259. El arco sobre el ábside fue tapiado en ladrillo a principios de los años 1300, permitiendo así un fresco en forma de luneta de Madonna con Niño. , Dos Santos y Donantes, que se atribuye a un artista Paduan anónimo activo entre 1325 y 1330, que había adquirido experiencia del 'Maestro del Coro Scrovegni', y también fue influenciado por el lenguaje de Pietro y Giuliano da Rimini. La tercera pilastra a la derecha conserva un fragmento de una composición más grande que representa a la Virgen y el Niño en una conversación cariñosa. Este trabajo es realizado por un maestro conocedor de los estilos de Venecia de 1370 e informado sobre las técnicas maduras de Guariento. La forma del fresco refleja los cambios posteriores en la pilastra hecha para la construcción del techo abovedado, a finales de los años 1300. El tabernáculo de los santos sacramentos con dos santos franciscanos puede fecharse a principios de los años 1400 y está vinculado a los estilos de Jacopo y Pierpaolo delle Masegne. fue comisionado por el rico panadero, Bartolomeo di Gregorio, quien también encargó la base del altar principal, por Andrea Mantegna, ahora perdida.