O Museu de História Natural da Academia de Ciências de Siena chamado de 'fisiocriticitici se originou com a fundação da Academia (1691).
O museu é chamado de história natural porque inclui achados dos três principais reinos da natureza: animal, vegetal e mineral.
O museu nasceu e se desenvolveu, desde o final do século XVII, principalmente graças aos dons das coleções de estudos de muitas fisiocritas e apaixonadas por ciências naturais.
O objetivo das coleções era procurar e mostrar publicamente a verdade dos fenômenos da natureza.

Os achados aumentaram com as coleções de Giuseppe Baldassarri (1705-1785), um médico e professor de história natural da Universidade Sienese, além de superintendente à coleção de história natural da academia e presidente do Mesmo até a morte.
A esses foram adicionados as coleções de Biagio Bartalini (1750-1822) que o sucederam na cadeira e aos cuidados do museu.
O museu tomou consistência na segunda metade do século XVIII, enriquecendo -se ao longo do tempo por meio de doações;Ele coleta coleções em grande parte do sul da Toscana.
Por volta de 1970, o museu foi reorganizado preservando a exposição do século XIX;As melhorias são constantemente feitas para maior usabilidade de ensino.
Desde 1996, ele faz parte do sistema de Museus Sieneses, hoje Fondazione Musei Sienese.