No final da Idade Média, o edifício que hoje é Palazzo Blu pertencia a uma das famílias mais importantes da história de Pisa, os Dell'agnellos, que moravam em duas casas de torre lado a lado.Em 1356, eles decidiram se juntar a outros de suas residências, construindo uma ponte sobre uma rua já existente.Este segundo edifício fica no lado leste do Palazzo, de volta para o sul.O resultado deste trabalho foi declarado pelas fontes contemporâneas como um prédio muito bom e Palzzo ("Bellissimo Edificio E Palazzo"), ideal para o status político dessa família que, em 1364, se tornou Doges of the City.Apesar de ser exilado em 1368, os dell'agnello foram capazes de manter o prédio: quando, em 1494, o rei francês Carlos VIII chegou a Pisa, ele ficou na casa de Messer Giambernardino dell'agnello, Lungarno Santa Cristina.

Nos anos 1500, o Palazzo passou para o Santaciani e depois para as famílias Del Testa.Em algum momento entre 1577 e a venda em 1789 para os Bracci Cambinis, a fachada foi reprojetada com janelas retangulares emolduradas em arenito e uma porta central encimada por uma janela ajoelhada com uma varanda.Em 1807, o prédio era de propriedade da família Count Archinto, que também comprou parte do concurso público para ampliar a fachada em direção ao oeste.Eles cobriram a ponte antiga e estreitaram a rua ao lado da Igreja de S. Cristina.

A cor da fachada data desse período, talvez para agradar os convidados de São Petersburgo que moravam lá.Em 1864, foi comprado pelo Pisan Nobleman Domenico Giuli, que construiu uma nova ala, para tornar a fachada simétrica e conectou -a a Palazzo Casarosa, sua propriedade.Nos anos posteriores, o Palazzo se tornou como é hoje.

O Fondazione Pisa comprou o Palazzo no início do século XXI, onde transferiu sua sede e criou um centro de atividades e exposições culturali.