As instalações do museu estão no antigo nuovo Spedale, construído em meados do século XIII, pelo testamento do papa Alexandre IV por ser um "Pellegrinaio" (refúgio para peregrinos) de registrar a reconciliação entre Pisa e a Santa Sé.Devemos o Spedale a Giovanni di Simone, por alguns considerados o arquiteto do cemitério monumental.

O edifício permaneceu parte do hospital até 1969, quando foi decidido renová -lo e usá -lo como instalações para o Museo Delle Sinopie.Em 27 de julho de 1944, uma granada filmada da American Artillery ateou fogo ao teto do Camposanto.O chumbo fundido derramou sobre os afrescos nas paredes.Na época, pensava -se que o único remédio para salvar essas pinturas era retirá -las das paredes.Esta operação revelou as sinopias, ou seja, os desenhos preparatórios em ocre vermelho embaixo dos afrescos.Devido à sua vulnerabilidade, estes também foram retirados das paredes e colocaram o novo museu, projetado, preparado e organizado por Giovanna PianCastelli Politi, Gaetano Nencini E Antonino Caleca.

Esta é a maior coleção de desenhos medievais do mundo.Nele, percebemos o artista que trabalha em toda a sua criatividade.Em muitos lugares, várias mãos podem ser distinguidas, mesmo onde o resultado final é uniforme em estilo, por exemplo, na crucificação atribuída a Francesco Traini (1335) e ao triunfo da morte, no último julgamento e ao ciclo de TheAid, provavelmente o trabalho de Buffalmacco.Os desenhos preparatórios (sinopias) dos ciclos posteriores (final de 1300 a 1400), como as histórias de Jó, de Taddeo Gaddi, as histórias de St. Ranier de Andrea Bonaiuti e histórias do Antigo Testamento de Benozzo Gozzoli também estão em exibição nomuseu.