Também conhecido como Igreja de Imacolata, é a segunda maior igreja após a Catedral de Messina.Fundada em 1254, está em Viale Boccetta.

A igreja foi reconstruída várias vezes.Em 1884, o edifício foi destruído por um grande incêndio.Por causa do incêndio, muitas obras de arte foram perdidas e apenas as estátuas de São Francisco dos Imaculadas e de Santo Antônio foram salvas do incêndio.

Após o terremoto de 1908, foi reconstruído novamente.Uma capela foi dedicada a Santo Antônio de Pádua.A estátua do santo permaneceu aqui e a capela foi construída na célula onde ele costumava ficar.A estátua dedicada a ele foi encontrada sob os detritos e guardada no Museu Regional até que a construção fosse concluída.Mais tarde, foi colocado em um canteiro de flores na parte de trás dos APSEs em 1990. A reconstrução da igreja, que lhe deu uma simplicidade e beleza originais, começaram em 1926, e foi inaugurada em 1928. Após os atentados da Segunda Guerra Mundial,, foi restaurado novamente e o trabalho terminou em 1954.

No interior, durante os séculos, havia os monumentos funerários do rei Frederic III de Aragon, de sua mãe Elisabeth e de seus filhos (William e John);Os túmulos foram posteriormente unificados em um mausoléu em 1554 pelo vice -rei de Vega.

Possui apenas uma nave, provavelmente de estrutura provencal, e o teto é de madeira.O santuário, depositado em comparação com o nível da nave, possui três APSEs semicirculares com bacias com nervuras.Nas paredes, existem algumas capelas, introduzidas por arcos largos.Os portais, a janela de rosas da fachada e os APSEs (reconstruídos pouco a pouco após o terremoto) são originais.Se você teve a oportunidade de admirar a pintura La Pietà, que Antonello da Messina pintou em 1475, e agora é exibido no Museu Correr de Venezia, percebe que a Igreja de São Francisco de Assis tem seu estilo original, como visto em visto emO pano de fundo onde parece que séculos nunca passaram!