Localizado na cidade antiga, a igreja foi originalmente dedicada a Santa Maria Degli Alemanni e já foi a sede dos Cavaleiros Teutônicos: hospedou, de fato, a imagem sagrada de Nossa Senhora dos Alemanni.
No final do século XII, muitos estavam os alemães a caminho de Jerusalém passando por Bari: o número aumentou consideravelmente depois que os suabianos se estabeleceram lá.

Em 1492, o papa inocente VIII, mediante solicitação de Ludovico Il Moro, deu a igreja aos pobres clares, e o nome mudou para St. Clare.
Mais tarde, a igreja foi desamarrada pelos Cavaleiros Teutônicos e passou por várias reformas.
Em 1861, foi transformado em quartéis.
Em 1897, a parte superior da torre sineira do século XVIII foi demolida.

A fachada, caracterizada por linhas extremamente simples, é feita com pedra não caiada de branco.A planta tem uma única nave e o altar está no estilo barroco e abriga o sarcófago de St. Clare.
O chão uma vez em Majolica, hoje é feito com mármore fino.
A igreja contém pinturas dos artistas do século XVII, Gliri Nicola e Andrea Miglianico (aluno de Luca Giordano).