Obecny wygląd Pałacu Królewskiego, siedziby dynastii, które rządziły Pizą we współczesnych czasach, jest wynikiem odbudowy pod koniec XVI wieku, dzięki woli Francesco I de 'Medici, który postanowił porzucić „Palazzo Vecchio” znajdujący się obok Kościół San Matteo i kupić ziemię i domy w okolicy między Santa Maria, kościół św Mikołaja i rzeki l'Arno. Nowy pałac to pojedynczy budynek z widokiem na Lungarno. Jedynym budynkiem, który wcześniej został oszczędzony, była „Wieża Złotego Pręta” (della Vergadoro), z której Galileo podobno pokazywał nocne niebo Wielkim Książętom za pośrednictwem swojego teleskopu.
Dziś Palazzo Reale, siedziba Soprintendenza ai Beni Artistici, Paesaggistici e Demoetnoantropologici, mieści także kolekcję Narodowego Muzeum Superintendencji, ustanowionego w 1989 roku.

Kolekcja antyków z kolekcji Gioco del Ponte, wydarzenie ekskluzywne w Pizie, datowane na średniowiecze, odbywające się co roku na Ponte di Mezzo, jest wiele portretów rodzin Medyceuszy i Lotaryngii, namalowanych przez znanych artystów, takich jak Bronzino e Tempesti. Istnieje również kolekcja gobelinów i cennych mebli, które należały do ​​rodzin Medici, Lorraine i Savoy.

Dzięki darowiznom i przejęciom muzeum posiada ważne zbiory dotyczące poszczególnych obszarów: na przykład zapis Ceci jest znaczącą grupą obrazów flamandzkich i włoskich z XVI-XVIII wieku, antycznych mebli i cennej ceramiki z Włoch i Anglia. Znajduje się tu także bogata kolekcja odlewów gipsowych i obrazów Italo Griselli, ważnego włoskiego rzeźbiarza i portrecisty z pierwszej połowy XX wieku.
W muzeum odbywają się również ciekawe wystawy czasowe.