Il museo conserva circa 150 opere presepistiche raccolte nel corso degli anni che testimoniano la tradizione, la creatività, l'arte e la cultura triestina ed offrono una panoramica ampia ed esauriente sulle varie interpretazioni della natività in Italia e nel mondo. Vasta la gamma dei materiali usati per la loro realizzazione: carta, legna, cera, polistirolo, conchiglie, filtri di sigarette, cartone, sughero, terracotta ed altri ancora. Interessanti i grandi presepi tradizionali animati con tanti movimenti e giochi di luce. Un particolare settore del Museo è riservato ai presepi cosiddetti "Triestini" ambientati in un contesto scenografico con scorci caratteristici e significativi della città e della sua provincia. Il museo è inoltre dotato di un laboratorio presepistico a disposizione di tutti coloro che sono interessati alla costruzione del Presepio.