Muzeum se může pochlubit největší a ohromující sbírkou listů papíru patřící Leonardovi, Codex Atlanticus.Tyto listy jsou na výstavě na tématech, které se navzájem sledují každé tři měsíce v galerii a v Sacrestia del Bramante (přes Caradosso, 1, v komplexu Santa Maria Delle Grazie v Corso Purnta)).Při této příležitosti jsou nyní pro veřejnost otevřeny Leonardi Hall s nádherným freskem „Incoronazione di Spine“ od Luiniho a novou výstavou Ritratto di Musico (Portrét hudebníka) Leonardem, Federiana Hall, původní sídAmbrosiana Library a Peristilio, budova ze 17. století, kde jsou vystavovány jiné Leonardovy díla, jako jsou uzly a portrét Leonarda, který byl nakreslen jedním z jeho učedníků.Je také možné vidět kopii poslední večeře od Vespina.Předtím, než se přesune do krásy Pinacoteca Ambrosiana, stojí za to se podívat na historii svého zakladatele Cardinal Federico Borromeo.
Každý obraz může být spojen s fázím kardinálového života.Byl důležitým patronem umění a byl v kontaktu s největšími umělci dne.Exponáty proto ilustrují jeho korespondenci s jinými italskými kardinály a s sběrateli a uměleckými odborníky, jako jsou Zuccari a Francesco Maria del Monte.Kolekce galerie je výsledkem nejen kardinálové činnosti, ale také všech lidí v jeho coterie.
Příběh začal v roce 1618, kdy se kardinál rozhodl přidat svou velkou a prestižní sbírku obrazů do knihovny Ambrosiana, založený v roce 1603 a otevřený v roce 1609. Důvod tohoto rozhodnutí spočíval v jeho ambici zpřístupnit jeho sbírku zpřístupnit jeho sbírkuvšichni a zvýšit povědomí široké veřejnosti ve světě umění.Centrální jádro Pinacoteca Ambrosiana, jedna z nejoriginálnějších a systematicky uspořádaných uměleckých sbírek v Miláně, je založeno na posvátném umění.Sbírka se pohybuje od středověku do poloviny 16. století.Sekvence muzea zahrnuje slavné obrazy, jako je „košík ovoce“ Caravaggia, a Titianovo „Adoration of Magi“.Návštěvníci mohou prozkoumat rozdíly ve stylu kreseb Raphaela a Michelangela a obdivovat díla Leonardovy školy a portrétování ze 16. století.
Sbírka umění, vyvinutá po celou dobu života svého zakladatele, rostla ještě po jeho smrti.
Kardinál pověřil několik děl od svého důvěryhodného umělce, kopií velkých mistrovských děl renesance, zejména těch Leonarda da Vinci, s cílem nechat viditelné dědictví pro budoucí generace.Na kopii tohoto mistrovského díla chtěl kardinál nápis: „Původní obrázky poslední večeře, alespoň ty, které zůstávají, mizí a tato kopie byla vytvořena tak, aby byly tyto obrázky nějak zachovány a že mistrovské dílo Leonarda nebude trvale ztraceno. "

Další kopie Vespina, která je přítomna v Pinacoteca, je Panna skály pravděpodobně po poslední večeři;Originál je v Londýně a kdysi zdobil kapli Neposkvrněného početí na konventu S. Francesco Grande, poblíž baziliky Sant'Ambrogia.Federico Borromeo začal sbírat v Římě a intenzivněji pokračoval v Miláně, kde věnoval svou pozornost malbě své doby ve městě.Jeho osobní známost s umělci Accademia di Pittura Dell'Ambrosiana, Mancone, Biffi a Crespi, hrál důležitou roli při péči o sbírku.
Umělecká aktiva Pinacoteca dnes činí více než 1600 děl.
Také zde je dlouhý zámek zlatých vlasů z Lucrezia Borgia, vévodkyně z Ferrary.Je konzervován ve vzájemném skleněném, bronzovém a malachitovém relikviáře;Během devatenáctého století se to stalo jakýmsi relikvií, fetišem, který přitahoval mnoho spisovatelů a básníků, kteří procházeli Milánem.Legenda má to, že na všech duších noc její duch klouže podél chodb a místností Pinacoteca při hledání rakve obsahující zámek vlasů, zbraň svádění a symbol marnosti.Jakmile se najde, umývá a pobíhá to, jako tomu bylo během svého života, a z tohoto důvodu je stále krásná, měkká a lesklá.