Stavba církve a kláštera vedle byla zahájena karmelitním řádem a první mše tam byla oslavena 25. května 1268 ještě před dokončením kostela.
Budovy prošly dlouhou řadou změn, které radikálně upravily jejich vzhled.V roce 1330 byl kostel téměř úplně zničen ohněm a částečně přestavěn, než byl opuštěn karmelity, kteří se přestěhovali jinde.Plány na přestavbu začaly v roce 1400 a práce začaly podle vlády Gian Galeazzo Visconti, ale v roce 1446, kdy byly budovy v pokročilé fázi dokončení, se kostel i klášter zhroutili.
Architekt Pietro Antonio Solari byl pověřen přestavbou v roce 1449 a k tomuto období lze připsat klenba a vnější části transeptu viditelného.V roce 1654 začala rozsáhlá rekonstrukce na podlaze, věži a hlavních dveřích.
Kostel byl zpočátku zasvěcen Zvěstování, jak naznačují dva bas-reliéfy podél hlavních dveří.Později vzal jméno církve čištění, než byl zasvěcen Santa Maria del Carmine.Po dlouhou dobu to byl referenční bod pro některé důležité řády, jako je slavná a mocná „škola oděvu Carmel“, která v nejranějším období (až do roku 1391) souhlasila s nadřazeností s „obloukovou konfternityoddaní čištění. “Zvonné, iniciované v roce 1664 Sandrini, byla Rakušané v 18. století snížena na výšku.Nedělní mše zahrnuje tři služby v angličtině, v 8,30 a.m., 10,30 a.m.a 4,30 s.m.Ve čtvrtek v 5 s.m.V angličtině a tagalogu je mše, přičemž druhý je nejdůležitější jazyk mluvený ve Filipínské republice.Fasáda je dobrým příkladem Lombardského neogotického umění, zcela v cihel a Terra Cotta.Jeho výstavba začala v roce 1673 a byla dokončena pouze v roce 1883, na design Antonia Pozzone.Carlo Maciachini to značně upravil a tyto změny získaly od současných vědců vážnou kritiku.