7. června 1981 arcibiskup Bari Mons.Mariano Magrassi postavil diecézní muzeum v Bari.Záměr byl inspirován diktáty II Vatikánské ekumenické rady, aby se vyhnuli „posvátnému nábytku a děl, které jsou vzácnými ozdobami z Božího domu, prodávání nebo rozptýlení“.Zpočátku sloužil jako úložný prostor pro umělecká díla a posvátný nábytek z církví ve stavu opuštění ze starověkého města Bari a celé diecéze.Muzeum bylo oficiálně otevřeno 16. června 1983. 12. září 1996 byla vytvořena první výstava Treasury Hall, Exultet Hall a Art Gallery.Dne 11. září 1998 bylo na druhém pozemku zahájeno zřízení lapidáru Hall of Blessing, Exultet II a III a Hall of the Church Roungments.Po přemístění kanceláří Curia arcibiskupem Francisem Cacucci byla zbývající oblast prvního patra navržena jako muzeum.