O primeiro antiquário no palatino foi criado na segunda metade do século XIX em um prédio ao lado do Domus Tiberiana.Mantinha o material proveniente de escavações encomendadas por Napoleão o terceiro.Quando o edifício foi demolido em 1882, o material foi transferido para o complexo das termos de Diocleciano.

Durante os anos trinta, Alfonso Bartoli, que havia conduzido escavações bem -sucedidas no Domus Augustana, estabeleceu o atual antiquário no palatino, lendo o convento preexistente das freiras da visitação.

Os materiais das termos de Diocleciano e das recentes escavações no palatino foram movidos para esse novo local.No início da Segunda Guerra Mundial, uma grande quantidade de descobertas foi transferida para os armazéns da superintendência das finanças na Piazza Delle Finanze por razões de segurança.

No final da guerra, decidiu -se deixar os materiais com um alto valor artístico no Museu Nacional Romano e mover os mais fortemente ligados ao local e a seus monumentos para o antiquário no palatino.

Atualmente, o Antiquarium exibe materiais da era proto -histórica, proveniente da vila da cabana em Germalo, reproduzida através de um modelo plástico;Stones Labs encontrados perto dos templos de Magna Mater, Victory e Apollo;Material escultural (estátuas, capitais e fragmentos de decorações arquitetônicas) provenientes dos palácios imperiais;Parte da decoração pictórica do Domus Transitoria de Nero.

Um grafito blasfêmico vindo do pedagogio que representa um crucifixo com a cabeça de um burro é famoso.Por fim, os afrescos da Aula Isiaca são exibidos em uma sala adjacente do Domus Augustana, que também mantém parte das decorações do século XVI do Loggetta Mattei.