O museu está localizado dentro do Palácio da Universidade, com vista para o Cortile Dei Caduti, o antigo pátio médico da universidade.

inaugurado em 1936, mantém manuscritos, textos impressos, ferramentas científicas preparadas anatômicas e naturalistas que constituem um testemunho da história da universidade, a partir de suas origens medievais.

Na segunda metade do século XVIII - quando, seguindo as reformas desejadas pela Imperatriz da Áustria Maria Teresa, a Universidade de Pavia se tornou um centro científico mais cortado na Europa - os núcleos i originalmente A partir das principais coleções, a seção de física, coletada em torno das ferramentas do antigo laboratório de Alessandro Volta e da seção de medicina, herdeiro das coleções anatômicas que Antonio Scarpa havia organizado com precisão nas instalações que atualmente hospedam o museu.

Na seção de medicina, dividido em três salas, ferramentas e preparações são preservadas que se referem à atividade da Escola Anatômica de Antonio Scarpa e do Museu de História Natural de Lazzaro Spallanzani, ambos chegaram a Pavia No final de Pavia, no final do século XVIII, para progredir no campo da cirurgia e clínica até os séculos XIX e XX, com figuras como Luigi Porta e Carlo Forlanini, e para a atividade da escola científica fundada por Camillo Golgi, o primeiro italiano para vencer - em 1906 - O Prêmio Nobel de Medicina, graças ao desenvolvimento de um método histológico que lançou os fundamentos da neurociência moderna.

Na seção de física, o gabinete de física de Alessandro Volta foi reconstruído, que estava originalmente localizado no primeiro andar, com vista para a varanda legal, em locais adjacentes ao teatro físico.

Sob a direção do tempo, a partir de 1778, o gabinete estava equipado com as mais recentes ferramentas para ensino e pesquisa e tornou -se um lugar admirado por numerosos visitantes italianos e estrangeiros.Uma segunda sala recebe as ferramentas usadas pelos sucessores da época durante o século XIX.

O museu também preserva um arquivo que abrange uma extensão cronológica desde o início do século XV até o século XX.A documentação, particularmente interessante em relação à história da medicina, constitui uma integração importante do que é preservado nos Arquivos Estaduais de Pavia (Arquivo Antigo da Universidade) e no Arquivo Histórico da Universidade.