A data de abertura continua sendo um mistério, mas é provável que os negócios da Bar Margherita tenham começado no final do século XIX.O local onde fica, de fato, era um dos mais populares da cidade: chamado Canton Delle Busie, que é a esquina das mentiras e abrigava os mediadores comerciais que negociam e a parada por mercadorias enviadas no rio.No guia histórico, artístico, biográfico e ilustrado de Pádua e seus arredores de Meneghesso (1926), o café é definido como um ponto de encontro imponente e elegante da noite.Desde 1981, seu proprietário é Ignazio Aggujaro.

O bar foi completamente reformado e, graças às suas salas internas, no inverno, e às mesas sombreadas, na estação quente, localizadas em um dos cantos mais marcantes de Pádua, ao pé do 13º-Century Palazzo della Ragione, é um ponto de referência para turistas e paduanos, além de estudantes da universidade vizinha.