De aanwezigheid van de Franciscanen in Lucca werd meteen relevant sinds 1228, hoewel de kerk werd herbouwd en uitgebreid in de veertiende eeuw.Binnen de kerk zie de kloosters met middeleeuwse graven langs de noordkant en de sacristie van de dertiende eeuw, met een centrale pijler die wordt gebruikt om de bogen te ondersteunen.

De kerk herbergt het graf van Giovanni Guidiccioni (1500-1541) bisschop, dichter en humanist.Een plaquette ter nagedachtenis aan Castruccio Castracani van Antelminelli, Distinguished Citizen en Leader of Lucca is er ook.

In de kapel rechts van het belangrijkste altaar zijn de overblijfselen van het begrafenismonument van Ugolino Visconti, gouverneur van Pisa, uitgeschopt door zijn grootvader Ugolino della Gherardesca (1288).Zijn hart en zijn darmen werden in een kist gehouden die eindigde toen verloor tijdens de renovatie van de kapel, in 1746.

ook genoemd door Dante Alighieri in het zevende stuk van het vagevuur, ter ere van Ugolino Visconti, een plakIn het Latijn werd in de kerk van San Francesco geplaatst: het begint met de woorden "qui è il cuore illustle del nobile ugolino, giudice di gallura ..." ("Hier is het hart van de illustere edelman Ugolino, rechter van Galura ... ").