La Casa della Dogana est considérée comme l’un des plus beaux édifices romains de Padoue et a bénéficié d’une restauration complète et précise. Il a été construit près de la porte médiévale de San Giovanni delle Navi, en 1294, sous le podesta de Nicolo Morosini. La douane a joué un rôle important dans le contrôle du commerce en provenance de Monselice. Il s'agit d'un exemple de la typologie des bâtiments à portiques du XIIIe siècle, attribué à l'architecte Leonardo Zise Bocaleca da Monselice, qui était également actif à la fois au palais de la commune et à l'église Saint-Antoine. Le haut portique est inspiré du même style du XIIIe siècle que le Palazzo della Ragione. Lors des rénovations de 1611, documentées par une date inscrite sur un cadre de fenêtre, la mezzanine originale à plafond de bois a été remplacée par une structure en brique soutenue par un portique à arcades basses. Les fenêtres à une seule arche de la façade du premier étage sont ornées d'une élégante double ouverture fermée par un arceau et un archivolte ornés d'un motif de petits losanges. Ce motif est dérivé de la tombe d'Antenore, également de Bocaleca, et se retrouve dans divers bâtiments privés de la seconde moitié des années 1200. Le côté du bâtiment faisant face à la Riviera de San Benedetto montre les bras de la commune de Padoue et le podesta de Morosini.