Die Capitolare-Bibliothek befindet sich im Palast des Canonicato. Sie wurde im fünften Jahrhundert als "Scriptorium" gegründet und ist eine der wichtigsten kirchlichen Bibliotheken in Europa. Hier sind alte Bücher mit Miniaturen, wertvollen Manuskripten und vielen seltenen Publikationen erhalten. Highlights: die Istituzioni di Gaio, der einzige noch fast vollständige Text des römischen Gesetzes, eine Ausgabe des De Civitate Dei von Augustinus, der dem Verfasser wahrscheinlich zeitgenössisch ist; Lila Buch der Evangelien des fünften Jahrhunderts; das Lettere d'Oro e d'Argento auf violettem Pergament; zahlreiche Manuskripte des neunten Jahrhunderts und die von Scipione Maffei gesammelte Manuskripte.