Das Museum für Paläontologie von Neapel ist das jüngste der vier Mitglieder des Zentrums für Naturwissenschaften und Physik der Universität Federico II.
Es wurde 1932 gegründet, obwohl Fossiliensammlungen im Royal Mineralogical Museum von Neapel bereits vor diesem Datum im 19. Jahrhundert untergebracht waren. Heute befindet es sich im Kreuzgang der Heiligen Marcellino und Festo.
Stellt mehrere Sammlungen vor: fossile Fische aus Giffoni Vallepiana, Pietraroia und Castellammare di Stabia, Säugetiere (wie der Schädel eines jungen Elephas antiquus italicus), eine fossile Palme, Meeresreptilien und fliegende Reptilien.
Seit 1996 gibt es ein sehr gut erhaltenes Fossil von Allosaurus fragilis aus Nordamerika.