V pozdním středověku patřila budova, o které je dnes Palazzo Blu, jedné z nejdůležitějších rodin v historii Pisa, Dell'Agnellos, který žil ve dvou věžech vedle sebe.V roce 1356 se rozhodli se k nim připojit k jinému ze svých rezidencí tím, že postavili most přes již existující ulici.Tato druhá budova je na východní straně Palazzo, která se dále vrátí na jih.Výsledkem této práce byly současnými zdroji prohlášeny za velmi jemnou budovu a Palzzo („Bellissimo Edifio e Palazzo“) ideální pro politický postavení této rodiny, která se v roce 1364 stala dogy města.Navzdory tomu, že byl v roce 1368 vyhnán, dokázal Dell'Agnello udržet budovu: když v roce 1494 přišel do Pisy francouzský král Karles VIII, zůstal v domě Messer Giambernardino Dell'Agnello, Lungarno Santa Cristina.

V 1500s předal palazzo palazzo na Sancasciani a poté rodinám Del Testa.Někdy mezi rokem 1577 a prodejem v roce 1789 Bracci Cambinis byla fasáda přepracována obdélníkovými okny orámujícími se v pískovce a centrální dveře překonané klečícím oknem s balkonem.V roce 1807 byla budova vlastněna rodinou hraběte Archinto, která také koupila část veřejného haly, aby zvětšila fasádu směrem k západu.Pokryli starobylý most a zúžili ulici vedle kostela S. Cristiny.

Barva fasády pochází z tohoto období, možná potěšení hostů z Petrohradu, kteří tam žili.V roce 1864 ho koupil Pisan šlechtic Domenico Giuli, který postavil nové křídlo, aby se fasáda symetricky stala a spojila ji s jeho majetkem Palazzo Casarosa.V pozdějších letech se Palazzo stal dnes.

Fondazione Pisa koupil Palazzo na počátku 21. století, kde přenesl své sídlo a vytvořil centrum pro kulturní aktivity a výstavy.