Öppnade i samband med jubileet 2000 och täcker stiftsmuseet nästan 2 000 kvadratmeter i hallarna i biskoppalatset.Den samlar dyrbara verk av målning, skulptur och guldsmithry, koder och incunaboli (böcker som saknas frontomslag, tryckta på 1500 -talet när konsten att skriva ut var i dess gryning), heliga kläder som kom från territoriet i stiftet Padua.Uppvisas i detta utrymme enligt kronologiska kriterier och efter sektioner vittnar verken till den kulturella rikedomen, den konstnärliga känsligheten och kyrkans djupa tro i Padua sedan århundradena före år 1000 e.Kr. till nutiden.
Resplanen börjar från rummet San Gregorio Barbarigo där vi hittar ett antal manuskript, till exempel 1400-talets antifonari i katedralen, anmärkningsvärt för deras konstnärliga likhet med Giottos målningar i Scrovegni-kapellet.1300 -talet representeras av ett stort antal konstverk av kända konstnärer, såsom korsets relikvist i Golden Silver, tillverkad i Danmark;Bland målningarna den vackra Madonna med barn av Giusto de 'Menabuoi och en fresco som kommer från en yttre vägg i dopet som representerar porträttet av en ung pojke, förmodligen från familjen Da Carrara.Serien med sju tabeller som avbildar några avsnitt från Saint Sebastians liv är mycket intressant;Det målades 1367 av Nicoletto Semitecolo, en samarbetspartner för Guariento.