Созданная в 1923 году в ознаменование 400-летия со дня смерти Пьетро Перуджино, она была открыта в 2000 году с новой планировкой, которая пронизывает 25 комнат на двух этажах, благодаря памятным останкам Палаццо ди Мартино IV, Палаццо деи Консоли и Палаццо. дель Капитоли деи Каноничи. В подземном своде находится каменная табличка, относящаяся к городской планировке Перуджи в этрусско-римские времена.

Представляя произведения искусства и религиозные украшения из церквей по всей епархии и из собора, а также пожертвования, он хранит многочисленные картины и скульптуры с 14 по 19 века, в том числе работы из мастерских Арнольфо ди Камбио и Аньоло Дадди и другие Мео да Сиена, Джанникола ди Паоло и Бартоломео Капорали. Ранний маньеризм и 17-й век представлены работами Данти, Скарамуччи и Батини. Особого внимания заслуживает алтарь Сант'Онофрио, созданный Люкой Синьорелли (1484 г.), на котором изображена восседающая на троне Мадонна с младенцем, играющая на музыкальном инструменте, а также по бокам Иоанн Креститель и святые Онофрио и Лоренцо вместе с комиссионером.