У церкви Санта-Мария-Инкороната есть особенность, которая сразу поражает посетителя: она состоит из двух зданий, первоначально отдельных, объединенных в 1484 году. Первое, которое соответствует нынешнему правому проходу, было построено по желанию инициированного Франческо Сфорца в 1451 году, хотя второй, который отличается незначительно, был построен несколько лет спустя.
Интерьер был когда-то украшен фресками и циклами картин, но теперь в основном выкрашен в белый цвет.
Внутри церкви со сводчатыми потолками, поддерживаемыми колоннами, с правой стороны расположены три часовни в форме многоугольника.
Завершено около 1484 года (по мнению некоторых историков дата может быть 1487), имя архитектора неизвестно, хотя некоторые эксперты ссылаются на Пьетро Антонио Солари, который, возможно, был автором южного прохода.
Самая старая церковь, слева от церковного двора, управлялась отцами Эрмитани из Сан-Марко и называлась Санта-Мария-ди-Гараньяно.
В начале XV века рядом со священным местом был построен монастырь для августинских монахов, которые восстановили старую церковь в стиле поздней готики. Поскольку работа была завершена как раз во время коронации Франческо Сфорца в качестве герцога Миланского (1451), она была названа Санта Мария Инкороната и посвящена новому лорду. Несколько лет спустя леди Бьянка Мария из Кремоны хотела построить почти идентичную церковь рядом со своим мужем, объединившись в единую церковь. В церкви много работ, представляющих большой интерес, таких как «Кристо сотто иль Торкио» («Христос под крестообразной печатью») Бергоньоне, а также прекрасная и живая серия барочных фресок из жизни Николая Толентского, вероятно, Сиро Ферри.
Большой интерес представляет библиотека монастыря, примыкающая к церкви, расположенная на первом этаже; У этого есть три прохода, поддержанные тонкими колоннами, некоторые из которых являются частью оригинального художественного оформления в искусственном мраморе.
Местоположение также представляет особый интерес по той причине, что это одна из немногих живописных библиотек в Милане на сегодняшний день. Оскверненные картины были обнаружены под слоями извести и гипса, которые скрывали их присутствие. Реставрация этих картин была завершена в 2000 году.
На сводах центрального нефа отчетливо видно сияющее солнце, символ Сант-Агостино, в то время как отцы церкви изображены на сундуках. Эта часть монастыря была известна тем, что была важным культурным кругом, настолько, что интеллектуальные и знаменитые люди города пожертвовали целые коллекции книг и драгоценных кодексов, которые сейчас хранятся в Библиотеке Амброзиана. В трапезной был также нарисован Распятие на стене, созданной в первом десятилетии шестнадцатого века, которая затем была расчленена и помещена вне церкви.