A abadia de San Zeno foi construída no século IX nos restos de um mosteiro pré-existente, cujas origens datam do século IV.Hoje, apenas a torre da abadia e alguns dos claustros que agora fazem parte da Basílica de San Zeno sobreviveram.A abadia tem sido muito importante para a história de Verona e para as relações entre os imperadores alemães e a Itália.Foi destruído principalmente durante a era napoleônica e, portanto, não seguiu o destino das outras propriedades da abadia em Verona, que foram capturadas pelos franceses antes de se tornarem propriedades de propriedade austríaca, às vezes resgatadas como no caso de Santa Maria em Organo.Desde o início do século XIX, iniciou um período de descarte da antiga abadia e convento beneditino, que terminou em meados do século XX.Desde a Segunda Guerra Mundial, várias restaurações foram executadas, em particular a torre e parte da abadia original, agora completamente restauradas e abertas para visitar.