Construído por Sigismondo Pandolfo Malatesta, o governante de Rimini de 1432 a 1468, o templo fica em um local ocupado pela Igreja de Santa Maria, em Trivio, e a partir do século XIII a partir da Igreja de San Francesco.Isso foi decorado com pinturas que agora foram perdidas, além de uma crucificação de Giotto, o único trabalho desse artista em Rimini, que remonta ao início dos anos 1300.Perto da igreja, havia um mosteiro e um cemitério no qual vários membros da família Malatesta foram enterrados.

Com o templo, nunca concluído em sua vida, Sigismondo conseguiu sua ambição de reunir suas relíquias familiares em um único lugar.

O trabalho no templo começou em 1447 com a abertura de duas capelas sepulcro para Sigismondo e sua terceira esposa, Isotta Degli Atti.Sigismondo então decidiu reconstruir a igreja em sua totalidade, confiando o projeto a Leone Battisti Alberti, que foi inspirado pelas tradições romanas, como visto na fachada e nas paredes laterais, que se lembram do arco de Augustus e da ponte de Tibério.A elegância do exterior foi combinada por ricas decorações de interiores.Matteo Dei Pasti e Agostino di Duccio trabalharam com uma sensibilidade quase pictórica nas faces de mármore das seis capelas laterais.

As decorações podem ser interpretadas de várias maneiras, desde a celebração do amor de Sigismondo e Isotta com temas filosóficos, mas o que surge acima de tudo é a personalidade de Sigismondo, vista ajoelhada antes de St Sigismund em um Fresco de PieroDella Francesca, e também dominante na representação de Rimini na capela dos planetas, acima do qual é o sinal de câncer, o próprio signo do zodíaco de Sigismondo.