Embora a historiografia local tenha dado crédito à presença lendária dos dois frades dominicanos Sisto e refresco, os arquitetos da Igreja Florentina de San Maria Novella, há muito poucas notícias sobre a fundação do complexo Pistoia.Da mesma forma, a indicação vasiana de uma intervenção de Giovanni Pisano parece estar sem fundamento, à qual os historiadores de Pistoia atribuíram o coro do portal e da igreja.

É certo que os pais dominicanos, depois de oficiarem no pequeno oratório do crucifixo, ainda o custodiante de um importante afresco dos últimos anos do século XIII, fundou a nova igreja e o convento adjacente logo mais sobre metade do século XIII.

A Igreja de San Domenico, concluída apenas durante o século XIV, com sua única e grande nave, o transepto e as capelas do presbitério, apareceram imediatamente como um dos maiores e mais prestigiados edifícios religiosos da cidade.Os melhores artistas ativos em Pistoia entre os séculos XIV e XV deixaram o testemunho de seu trabalho.Entre eles, emergem os nomes de Giovanni Cristiani e Antonio Vite para os afrescos, e Bernardo e Antonio Rossellino para escultura.

A esses recebe o monumento fúnebre ao jurista Filippo Lazzari, ao primeiro altar à direita, e o sepulcro do abençoado Lorenzo da Ripofractta, a última escultura ainda é objeto de estudos.Há também o túmulo do bispo dominicano Andrea Franchi, que liderou a procissão de Bianchi por ocasião da praga de 1399. No convento durante o ano, o famoso pintor florentino Benozzo Gozzoli morreu.A igreja viu o trabalho entre Paolino, também um seguidor de pai dominicano de Savonarola como todo o convento de Pistoia, que pintou a mesa com a adoração dos Magos e uma conversa sagrada, a última presente na Igreja de San Paolo.

Nos séculos seguintes, a Igreja de San Domenico tornou -se objeto das transformações inspiradas no sabor que muda.As famílias nobres de pistóia o elegeram como um local de enterro, como vemos nas numerosas inscrições sepulcrais.Os panciatichi, os Chancellieri, os Cellesi, os Baldinotti, os Gatteschi e outros eram as famílias que queriam os altares ao longo das paredes da maior nave para eles.

Os afrescos com histórias da vida de San Domenico pintados por Sebastiano Vini no grande claustro são datados no final do século XVI, enquanto a reforma maciça que levou ao sacrifício das janelas que fecharam a hexafora de O coro é do século XVII e as lâmpadas únicas, substituídas pelas janelas barrocas.No mesmo século, as lunetas do pequeno claustro foram afresadas, reduzidas hoje para um lado apenas após os danos causados ​​pela guerra, com histórias da vida de Maddalena pelos pintores Ulysses Ciocchi, Michelangelo Cinganelli e Giovanni Martinelli, todos os estudantes da Florentina O mestre Bernardino Poccetti bombardeou seriamente na noite de 24 de outubro de 1943.