Het complex werd gebouwd in 1418 met een donatie van Carlo Malatesta, heerser van Rimini van 1385 tot 1429, die een landelijke verblijf in de buurt had.De kerk en het klooster werden de Augustinianen van St. Paul de eerste martelaar van Hongarije toevertrouwd, op onverklaarbare wijze in Hongarije in 1420 geroepen. Carlo gaf het complex vervolgens toe aan de benedictijnen van de berg Oliveto Maggiore, die de abdij en zijn landgoederen bezat tot 1797, toen ze zijwerden uitgezet tijdens de Napoleontische onderdrukkingen.

De Olivetans hebben de abdij sterk uitgebreid en veranderden.De oorspronkelijke kerk werd herbouwd en verbeterd met talloze kunstwerken.De vandaag geziene gevel draagt ​​de armen van Roberto Malatesta, de heerser van Rimini van 1468 tot 1482, maar het plafond met paneel met de armen van Carlo Malatesta in het midden is van een later tijdstip.De twee zijkapellen, die momenteel als sacristies worden gebruikt, werden in de vroege jaren 1500 toegevoegd en de rechterhand werd frescoed door Girolamo Marchesi da Cotignola.Giorgio Vasari (1511-74), die de abdij bezocht om een ​​kopie te laten maken van zijn "le vite de 'più eccellenti architetti, Pittori et Scultori Italiani, da cimabue insino a' tempi nostri", schilderde een altarpie voor de monniken in 1547-48 Toont de aanbidding van de wijzen, die nu in het koor hangt.Nadat de Orde van Olivetans was onderdrukt, kreeg de kerk de titel van de parochiekerk van San Fortunato, overgebracht uit een oudere kerk verderop de heuvel.

Het hele complex was ernstig beschadigd in de Tweede Wereldoorlog en is niet volledig gereconstrueerd.