Opgezet na voornamelijk prehistorische opgravingen uitgevoerd in de tweede helft van de vorige eeuw in het kader van een duidelijk evolutionistisch perspectief dat zich goed aanpaste aan het idee van vooruitgang die werd opgelopen door de positivistische ideologie van die tijd, werd het in 1871 ingehuldigd dankzij de VerlichteWerk van zijn eerste directeur, Carlo Boni.

De archeologische collecties, chronologisch en topografisch gerangschikt, zijn samengesteld uit werken uit een geavanceerd moment in de inferieure paleolithische periode tot de middeleeuwen.

bijzonder belangrijk zijn de prehistorische bevindingen, boven alle neolithische die van Fiorano en Pescale (5e -4e millennium B. C.) afkomstig zijn van de opgravingen van F. Malavolti, en die van de terramare -inwoners van de bronzen leeftijd - die -Vertegenwoordig de fundamentele kern van het museum - met talloze keramische, bronzen en hertenhoornobjecten.

De etnologische sectie, opgericht tussen 1875 en de vroege decennia van XX eeuw, bestaat uit bevindingen van verschillende geografische gebieden, die in veel gevallen getuigenis zijn om inmiddels uit te stoten of uit te sterven uit culturen.De huidige regeling van de collecties respecteert de oorspronkelijke 19e-eeuwse divisie in geografische gebieden: Nieuw-Guinea, Zuid-Amerika, Pre-Columbian Perù, Afrika en Azië.