De Romanesque Church of San Babila, gebouwd rond de Xi Century, had oorspronkelijk drie NAVES en drie APSES.Het grootste centrale schip werd verdeeld in drie baaien, waarvan de tweede een achthoekige lantaarnkoepel was.Het was verstoken van zijkapellen en sacristie.
De eerste wijzigingen waren in het Visconti -tijdperk, met de toewijding van twee altaren en de constructie van de sacristies.
Na het bezoek van aartsbisschop Visconti in 1591 werd besloten om meer radicale werken uit te voeren gezien de arme staat van de kerk.In feite leidde de restauratie in de barokperiode tot de sloop van de Romaanse gevel om een ​​baai toe te voegen aan de kerk, plus de sloop van de aps.
De wederopbouw was echter niet definitief.In de vroege XX eeuw werden de renovaties van de barokke stijl meedogenloos gesloopt om ruimte te maken voor de neo-RomeSque-veranderingen.In de loop van de tijd heeft het interieur ramen overgenomen van Bertini, picturale decoraties van Pogliaghi en Cavenaghi en het belangrijkste altaar van Moretti.
Andere werken werden op verschillende tijdstippen uitgevoerd: de Paleochristian Inspired Baptistery en de nieuwe kapel van de addolorata die een vervanging van een vervanging door bombardementen tijdens de Tweede Wereldoorlog vervangt.De geschiedenis van de stichting van de kerk van San Babila is het onderwerp geweest van talloze debatten, maar het lijkt er nu op dat er een consensus van mening is.Volgens legende was San Babila de eerste kerk gebouwd in Milaan in 46 AD op de plaats van een heidense tempel gewijd aan de zon.Dezelfde legende zegt dat het werd opgericht door S. Barnaba die zijn eerste mis daar zou hebben gevierd na het betreden van de stad.
In feite dateert de meest oude gegevens die het bestaan ​​van een kerk die zich toelegt op San Babila dateert uit de XII -eeuw en bevestigt dat het meer recent werd gebouwd door de priester Nazario Muricola.Daaropvolgende opgravingen voor de restauratie bevestigen deze nieuwste versie.