La Cannoniera di San Michele ha un’ampia sala di manovra, consta di tre vani con volta a botte e colonna centrale. Nel vano più alto si trovano due camini di ventilazione e sfogo per i gas prodotti dallo sparo. Nella cannoniera si notano le bocche per l’artiglieria, chiuse e confinanti con l’acquedotto, il cunicolo di sortita dei militari. Stalattiti e stalagmiti si sono formate grazie alla calce utilizzata per sigillare i materiali di costruzione.