L'église de San Gaetano alle Grotte se dresse sur les vestiges d'un ancien temple fondé en 262 j. C. de Sant'Everio, alors évêque, portant le titre de Santa Maria. Il est situé sur la Piazza Carlo Alberto, siège de l'historique Fera ô luni, à quelques mètres du sanctuaire de Carmine, à moitié caché par des bâtiments adjacents.

La première église, selon la tradition, a été construite en 262 ou au IIIe siècle dans une grotte de lave déjà utilisée comme citerne et portant le titre de Santa Maria. Le temple s'est probablement agrandi au 7ème siècle, et c'est peut-être pendant cette période que l'église apogéenne de San Gaetano a été baptisée Santa Maria La Grotta.

Au huitième siècle, avec la conquête musulmane de la Sicile, l'église supérieure fut démolie ou, plus probablement, abandonnée. Avec l'avènement des Normands, l'église fut restaurée et peut-être que les grandes colonnes du presbytère remontent à cette période, tandis que l'accès à l'église souterraine est réduit, devenant ainsi la crypte du temple supérieur, grâce à la construction d'un escalier raide pierre de lave.

Cependant, le temple inférieur, périodiquement inondé à cause de la présence de la source qui alimentait le vieux puits, fut bientôt bloqué par des débris boueux et tomba dans l'oubli. Seulement en 1558, le bâtiment fut nettoyé et nettoyé par les frères carmélites. A cette date peut-être la vénération du saint de Thiene, canonisé au siècle suivant, approche, comme à cette date peut être la dédicace au temple de Santa Maria di Bethlehem de l'hypogée, liée au culte de la Nativité, née en Italie après le oeuvre de saint François à Greccio.

Partiellement démoli en 1674 pour la construction du bastion voisin de San Michele (sur la base du projet de forteresse commencé plus de cent ans auparavant, en 1550 sous le règne de Charles Quint et achevé sur un projet de Tiburzio Spannocchi), il fut définitivement détruit par le tremblement de terre de 1693, probablement aussi à cause d'une maçonnerie inadéquate datant de la période médiévale, à laquelle s'ajouta l'instabilité due au démantèlement qui avait eu lieu près de vingt ans auparavant, et une partie du temple inférieur subit également les effets du séisme. La reconstruction a subi plusieurs modifications du projet et a duré longtemps, puisqu'elle n'a été achevée qu'en 1801 sous l'évêque de l'époque, Corrado Deodato Moncada. La reconstruction n'a eu lieu que grâce aux contributions de la confrérie de San Gaetano, formée depuis pour la conduite de l'église. Une fois abandonné après les dégâts causés par le bombardement des Alliés lors de la Seconde Guerre mondiale, il a été rouvert au culte dans les années 1980 puis rouvert à nouveau "hoquet". Actuellement, l'église inférieure, en plus des services ordinaires dirigés par le recteur, le père Antonino Lo Curto, est jumelée avec le monastère orthodoxe russe de Divnogorje et abrite la communauté orthodoxe catanane pour les messes dominicales.

Le 5 juin 2009 a été choisi comme cadre de la cérémonie d'investiture des nouveaux membres de l'Union internationale de cavalerie chrétienne (connue sous l'acronyme UCCI), célébrée par Lo Curto lui-même. Dans le même temps, les fonctions de l'église orthodoxe moldave de Parohia Sfintei Muceniţe Agafia din Catania se déroulent dans l'église souterraine.

À l'intérieur d'une grotte de lave qui a peut-être son origine dans l'éruption du Larmisi, une citerne souterraine a été construite à l'époque romaine, puis adaptée à l'utilisation du cimetière chrétien de la nécropole.

La plante primitive est devenue une église chrétienne en 262, peut-être la première construite à Catane, avant même l'église voisine du Saint-Esprit construite par l'évêque San Berillo et parmi les premières en Europe à porter son nom Maria. Initialement à la maison à un martyrion. Les traces les plus anciennes, avant la transformation en église, seraient à rechercher dans le puits sud où subsistent au plafond les traces d’une travée en briques de terre cuite, d’un archosolium (muré pour obtenir l’autel), d’une fausse fenêtre et de deux sièges en pierre. lave.

Avec l'édit qui a permis la liberté de culte de 313, le bâtiment a pu se doter des éléments structurels nécessaires aux fonctions sacrées, tels que l'autel (qui a probablement fermé le passage à un autre secteur de la grotte au nord vers le sanctuaire du Carmine) et l'arc de triomphe qui a tenu une iconostase. A cette époque, l’environnement était entièrement recouvert de fresques dont il ne reste aujourd’hui que des traces éphémères, si ce n’est une Vierge à l’Enfant du IIIe siècle, aux visages à peine visibles, dans le mur nord où l’autel est obtenu, remodelé plusieurs fois au cours des siècles suivants