La historia del monasterio de Olivetan en Pistoia se remonta a la segunda mitad del siglo catorce, cuando el obispo Giovanni Vivenzi bendijo la colocación de la primera piedra en un terreno todavía casi sin edificios y cerca de las paredes. Unos años más tarde, las obras ya estaban terminadas y el complejo que consistía en la iglesia, el claustro y las salas dispuestas a su alrededor, podía albergar el Capítulo General de la congregación, que se celebró por primera vez fuera de los muros de la casa madre: Abadía de Monteoliveto Maggiore cerca de Siena.

La notable disponibilidad económica lograda gracias a los ricos legados de los que fue objeto el monasterio entre los siglos XV y XVI para ampliar y reestructurar el núcleo original, incluso si los cambios más radicales se produjeron alrededor de la primera mitad del siglo. A continuación, cuando el salón de la iglesia se levantó y se volvió. En esta ocasión se agregaron los cuatro altares laterales. Aún en el siglo XVII, la fachada estaba arreglada y solo el coro con su bóveda de crucería gótica permanecía sin cambios. Los frescos en el claustro del convento se remontan a este período y, según la costumbre, vieron la participación económica de las principales familias de Pistoia.

En el siglo XVIII se hicieron más cambios en el convento, que en la segunda mitad del siglo por orden del Obispo Ricci fue suprimido y destinado a la sede de la Academia eclesiástica y su morada temporal. El nombre de la iglesia del convento se cambió a San Leopoldo, un homenaje al Gran Duque que fue un firme ejecutor de las ideas de Ricci. San Benedetto fue la sede del Sínodo diocesano que ratificó las reformas del obispo pistoiano. A partir de este momento comenzó un período de abandono para la iglesia y el convento debido a los usos indebidos que se hicieron de ella, por ejemplo, durante la ocupación francesa se usaron como cuarteles.

En la primera mitad del siglo siguiente, el complejo se unió al seminario episcopal por un corredor, siempre y cuando el camino que hoy se llama via del Seminario. La iglesia precedida por un pórtico sobre arcos contiene un fresco del pintor pistoiano Giovanni Cristiani que representa la Anunciación y un panel con Santa Francesca Romana del pintor Giacinto Gimignani.

Hoy, después de una cuidadosa restauración, el convento alberga un centro de asistencia para ancianos y la iglesia realiza funciones parroquiales.