Fundado en el siglo XVIII como las colecciones universitarias de paleontología y mineralogía, con las que comparte el origen, el Museo de Zoología y Anatomía Comparada tiene el objetivo de preservar los hallazgos de fauna de particular interés para el territorio local.
Siguiendo los legados de ciudadanos y compras modeneses, que tuvieron lugar varias veces entre 1830 y 1845, el patrimonio del museo creció rápidamente, especialmente en el sector ornitológico, también gracias a las frecuentes donaciones del duque Francesco. IV, tanto de especímenes exóticos criados en la corte y muertos en cautiverio, como de fauna local.
Recientemente, las colecciones zoológicas han visto un nuevo aumento gracias al material donado por organismos privados o públicos, o provenientes de incautaciones llevadas a cabo por taxidermistas o confiscadas a cazadores o el resultado de colecciones de estudios. Establecido en el Departamento de Biología Animal de la Universidad, ahora tiene alrededor de 3000-3500 vertebrados naturalizados (aves, mamíferos, peces, reptiles), de los cuales alrededor de un centenar pertenecen a la "fauna de vertebrados de la zona de Módena", montados en forma de pequeños dioramas. ; alrededor de 1000 especímenes de vertebrados (especialmente peces y reptiles) conservados bajo líquidos; unos 250 esqueletos y partes anatómicas de vertebrados; Unos pocos cientos de invertebrados conservados en alcohol o formalina.
El patrimonio también incluye una importante colección malacológica que consta de unos pocos miles de cajas, cada una con uno o más especímenes; Cien cajas entomológicas con un número desconocido de especímenes; una docena de vitrinas que contienen una rica colección de animales parásitos y venenosos (Colección Franchini).
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