La iglesia de los santos Giovanni y Reparata se encuentra en la parte románica del centro histórico de Lucca. Tiene una estrecha relación con la Catedral de San Martín, ya que es la primera sede de los obispos de la diócesis y el titular del derecho a la pila bautismal. En el siglo XIX, bajo el gobierno de Napoleón, se convirtió en el guardián de los archivos de la antigua República. En 1828 la iglesia fue re-consagrada para el culto.

El complejo religioso, formado por el baptisterio y la iglesia, se extendió por un considerable yacimiento arqueológico abierto al público en 1992. Las excavaciones significativas han sacado a la luz el sistema primitivo de la Basílica del siglo V y el adyacente bautisterio de los primeros cristianos.

En la basílica románica, se han encontrado restos de la primera catedral de Lucca, dedicada a Santa Reparata. En cambio, bajo el baptisterio, las excavaciones han recuperado una estratificación en cinco niveles correspondientes a las diferentes edades de la historia de Lucca, la fundación del "municipium" romano del primer siglo antes de Cristo hasta el imperio tardío, cuando el área se convirtió en el sitio de la Catedral. .

A partir de esto, se destacan las reconstrucciones posteriores de la Edad Media hasta el aspecto actual de la iglesia románica. Entre los artefactos más antiguos recuperados: un fragmento del pavimento de la cúpula romana en el primer siglo aC, las ruinas de los baños I-II dC, los entierros de la era lombarda y algunas evidencias del bautisterio medieval y la cripta carolingia.