El Jardín Botánico de Módena fue fundado en 1758 por el duque Francesco III d'Este, quien reservó una parte del jardín para la exposición de plantas medicinales.
En 1765 se creó la "Cátedra Pública de Botánica en ayuda de la Facultad de Medicina y Hierbas Aromáticas". Esto fue seguido por el procedimiento para la construcción de un "calentador" que hizo posible agregar plantas exóticas junto con las cultivadas anteriormente.
En 1772, con las Grandes Reformas Universitarias emitidas por Francesco III, los Jardines Botánicos pasaron bajo la Universidad.
En el mismo año, siguiendo un diseño del arquitecto Giuseppe Maria Soli, se instalaron las parcelas para el cultivo de plantas medicinales y se excavó un gran tanque ubicado al sur para ser utilizado para irrigación y para albergar acuáticos. flora.
Desde 1775 con University Reforms, la sección de Botánica se convirtió en una ciencia con el Prof. Roberto Francesco De Laugier, llamado desde Viena para presidir la sección.
Dio una orientación decididamente científica a los jardines, organizando las plantas según la clasificación de Tournefort e introduciendo varias especies de países tropicales.
Los vientos de la revolución se produjeron cuando las tropas francesas ocuparon Módena el 6 de octubre de 1796, socavando significativamente la universidad.
De hecho, la Universidad cambió su nombre a Lyceum y los Jardines sintieron las repercusiones incluso a nivel organizativo.
La adquisición de numerosas colecciones botánicas, incluido el rico Jardín del Conde Cattaneo de Novara, se remonta a esta época.
Alrededor de 1820 se agregó un programa de intercambio con 126 jardines botánicos en todo el mundo. Durante este período, los jardines fueron enriquecidos, en particular, por el Herbario establecido por De Brignoli.
De gran interés fue la donación realizada por el profesor Gibelli, quien legó su biblioteca y la colección de criptogramas vasculares a los jardines.
En la década de 1920, se adquirió el Herbario de líquenes del Doctor Baglietto, que junto con algunos otros que ya poseían, convierte al Herbario de Lichen en uno de los herbarios históricos más importantes de Italia.
Más tarde, se adquirió la importante colección privada de herbarios de General Vaccari y Emilio Chiovenda, que mejoró los activos botánicos con muestras de Eritrea y Somalia.
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