La Biblioteca Estense (Biblioteca Estense), fue la biblioteca familiar de los duques de Este. Con una antigüedad de al menos el siglo XIV, se enriqueció en gran medida durante el Renacimiento de Ferrara y finalmente se estableció en Módena a principios del siglo XVII.

La biblioteca está ubicada en el Palazzo del Musei y es una de las bibliotecas más importantes de Italia.
Hoy en día, la colección de la Biblioteca contiene más de 500,000 trabajos impresos, aproximadamente 11 000 códices, más de 100 000 hojas manuscritas y 1 662 incunables. Entre los manuscritos, el más famoso es la Biblia de 1 200 páginas de Borso d'Este, completamente bordeada de miniaturas.

La biblioteca contiene muchos manuscritos medievales, entre los que se encuentran los manuscritos bíblicos: Codex Mutinensis, Minúscula 358, 359, 585, 586, 618, 111.

La Biblioteca de la Universidad de Estense tiene una sala de exposiciones, Sala Campori, que en el pasado fue sede de la exposición permanente de códigos iluminados. En los últimos años, para satisfacer los numerosos intereses de los visitantes de la biblioteca, así como la decisión de mejorar una gran parte de la riqueza bibliográfica de la biblioteca, que de otro modo seguiría siendo desconocida, se han realizado exposiciones temáticas en la Sala Campori. .

Sin embargo, algunos códigos aún están en exhibición y son de particular interés desde el punto de vista histórico-bibliográfico: así como la Biblia de Borso d'Este que aún se exhibe en la sala y los dos mapas geográficos más valiosos que se conservan en el instituto - El Mapa de Catalana y el Mapa de Cantino - la mayor parte de las exposiciones presentadas en la Biblioteca de la Universidad de Estense también incluye el Misal de Borso, el Breviario de Hércules I, el Misal de Anna Sforza, De Sphaera.

También conocida en todo el mundo es su colección de manuscritos musicales y libros impresos, el Raccolta Musicale Estense.